Sreven Guttman当时担任首任产品经理，给Beta版起代号即是从那时开始。Photoshop 2.0的代号是Fast Eddy。2.0正式版于1991年2月发行。从此，Adobe成为行业标准。2.0的发行引起了印刷业的重视，并引发桌面印刷革命。
Adobe公司开始设立销售部门，并聘请了更多的软件工程师，包括Kevin Johnston。此时Adobe公司决定开发一个Windows视窗版本。Guttman把软件开发分成两个小组，由JeffParker领导的Mac 小组以及由Bryan Lamkin领导的Windows小组。这次开发进展很慢，因为他们必须重新编写Thomas最初的编码。尤其是Windows版本，似乎是一个完全分离的程序。Mac版本开发代号是Merlin,Windows版本则是Brimstone。Adobe决定把下一个版本标注为Photoshop2.5,至今无人知道为什么不标注为3.0。通常标注为.5都不会好销，因为人们觉得小数点后的数字通常留给修改升级。2.5版本增加了一些新的显著特征，调色板和 16-bit文档支持。尽管这个版本因为是Windows版本的第一版而备受瞩目，但是对于Windows系统，它有一个强大的对手，Aldus公司的 PhotoStyler。虽然Windows的使用者可以使用Photoshop,但是它并不包括那些新特点。同时，内存处理的一些错误很快便从市场反馈回来。当这些内存错误bug被查出并改进后，原来的版本升级为2.5.1。
第一个运行在Windows平台的Photoshop2.5
此时Photoshop在Mac版本的主要竞争对手仍是Fractal Design的ColorStudio，而Windows上面则是上文提到的Aldus的PhotoStyler。Photoshop从一开始就遥遥领先于ColorStudio，而Windows版本则经过一段时间改进后才赶上对手。
下一个版本3.0的研发在2.5还没完成便已开始，代号为Tiger Mountain。在这一版中，将着力加入图层这一新特性。Thomas主要即致力于图层的研发，同时与Hamburg和Johnston一起研发其他的新特性功能。Stern优化Power Mac版本Photoshop，而Seetha Narayanan则使Windows版本能与Mac版本同步。
当时研究Layers的还有LivePicture，是Photoshop劲敌。Live Picture的Layer具有将单独分离的元素多重地堆叠起来。当时也有谣言说Photoshop的工程师抄袭了LivePicture的Layers 特征，事实上，早在Thomas还未听说过LivePicture的时候，他便已开始研究Layer这一概念。对他来说，这个概念仅是为了方便在编辑图片的时候可以把物体单独分开。Photoshop3.0的Mac和Windows版本分别在在1994年9月底和11月发行。
麻烦重重的3.0版本
3.0版从研发到发行都充满了磨难。在它未发行之前，Jeff Pakler去度假了，留下一个没有管理人员的摊子。JohnLeddy必须一步一步地接替这个位置。在Beta检测过程中，又出现了Q&A (质量评估)麻烦。许多3.0版本中的特征几乎不能通过甚至完全不能通过。当时有谣言说Brown捏造了一些特征只是为了引起市场的轰动效益，缺乏证明使得Adobe的各个部门在信息业中几乎瘫痪。在版本3.0发行之后，程序出现了更大的故障。不知何故，beta终止编码没有响应。Adobe收回了出售的 3.0版本。3.0.1版本迅速发行。不幸的是那些试用者并没有归还软件，这个程序在1995年12月1日终止了运行。许多用户都意识到了3.0版的问题，这在用户中引起恐慌。Adobe尽最大的努力去替换3.0版的CD。通过网上服务， 3.0.1版更新3.0版。同样不幸的是，95年2月1日，日本版本同样出现beta终止警报。Adobe试图用版本更新的3.0.3版本解决这个问题，但这仍造成了很糟糕的影响。许多工程师离开了Adobe。这点小障碍并没有减小3.0版本使用者的热情，特别是对它的Layer(图层)功能。
